台肥公司於10月31日晚間突然宣布董事長人事異動，由行政院中辦副執行長吳音寧接替原農業部派任法人代表李孫榮，即日起生效。這項突如其來的人事變動引起各界關注，台肥員工對此感到驚訝，藍營立委也對此提出質疑。農業部表示此次改派是依規定進行，並強調吳音寧長期關心台灣農業發展，而吳音寧本人則表示需等待董事會正式決議。
國民黨立委王鴻薇對此人事案提出質疑，她指出吳音寧年薪將從250萬一下跨升到600萬，諷刺地表示「果然黨證對了，你的前途收穫滿滿」。吳音寧去年曾參選彰化立委，當時還獲得時任總統蔡英文的助選，但最終以兩萬票之差輸給謝衣鳳。國民黨立委謝衣鳳則表示，希望吳音寧能持續超越自己。
一方面，被換掉的台肥董座李孫榮擁有豐富的學經歷，他的董座任期原定從去年6月到2027年，等於才上任一年多就被調整。農業部對此人事案表示，是依規定推派董事代表，並表示尊重台肥董事會對新任董事長人選的決定。農業部同時強調，吳音寧長期關心台灣農業發展，相信必能為台肥公司帶來新氣象。民進黨立委郭國文則表示，李孫榮在任內推動諸多改革方向，不僅幫助農民，還協助台肥的轉型。他認為吳音寧過去在農業上有一定程度的參與和專業背景。吳音寧此次以空降之姿接任台肥董座，持續引發各界討論。
