花蓮馬太鞍溪堰塞湖溢流災情嚴重，已造成18人不幸喪生。行政院長卓榮泰宣布提出「丹娜絲颱風及728豪雨災後復原重建特別條例」修正案及追加特別預算，也就是追加兩百億元，用於災後重建工作。這項預算將涵蓋死者與重傷者慰問金、每戶10萬元的災後復原金、5萬元的污泥垃圾清理補助費，以及免除災區居民9月和10月水電費等多項措施。然而，此舉也引發朝野間的討論，國民黨立委傅萁表示將視政院誠意再決定態度。
在行政院會上，卓榮泰帶領全體官員為罹難者默哀1分鐘，並強調「923堰塞湖溢流事件」發生在丹娜絲颱風之後，因此適用該特別條例進行災後重建，在適用上沒有任何疑義。卓榮泰希望能盡速讓災區復原，並呼籲在野黨支持這項預算案。面對政院的提案，傅萁回應表示，國民黨有自己的版本，要先觀察卓榮泰是否有確定的誠意，能否將堰塞湖事件所有善後工作確實且務實地納入800億的條例中。
值得注意的是，國民黨日前已提出要草擬樺加沙風災特別條例，並在立法實務研討會中將其定為本會期排序第一的優先法案。對
此外，關於災害預警與撤離時機，也成為朝野爭論焦點。國民黨國政基金會副執行長凌濤質疑內政部未能及時疏散民眾，指控9月21日晚間6點台大團隊就已建議擴大疏散，但相關單位直到隔天7點才發布紅色警戒，要求檢討內政部長劉世芳的「重大失責」。對此指控，劉世芳展示通聯記錄反駁，強調從第三次開始到現在，傳真到通報的次數高達5至7次以上，顯示政府確實有進行相關通報工作。
