隨著民眾黨主席柯文哲遭收押禁見原訂9/27就要退休的陳佩琪，從北市聯醫的官網資訊就能發現，她的門診到月底前已經全面休診。聯醫對此證實，陳佩琪一路請假到月底，也就代表她已經提前退休。
似乎想遠離外界紛擾，上北市聯醫的官網就能發現陳佩琪的診11日開始一路到18日都是由其他醫生幫忙代診，北市聯醫發出公告證實接下來陳佩琪的門診工作26日前全部停診，訂退休日是9/27的她也就代表已經提前退休。
柯文哲妻子陳佩琪：「我打起精神來，我要跟他站在同一陣線。」
台北市議員(民)陳怡君：「(智堯資訊)公司究竟是陳佩琪替兒子開設的人頭公司，還是如同她又翻口供所說的兒子自己走進去銀行去開設的，陳佩琪自己要講清楚。」
因為陳佩琪至今仍是公務員身份，退休前卻用兒子名義開設人頭公司，公司怎麼開的七天內三度改口說詞反覆，涉嫌違反《公務員服務法》，聯醫認為陳佩琪沒經營商業，沒違法先交由司法偵查，雖然陳佩琪退休要為柯文哲四處奔走，但自己的爭議依舊存在。
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