國會改革法案三讀闖關後，朝野進入延長戰，外傳總統賴清德擬依照《憲法》職權啟動「院際協調權」，召集五院院長會商。不過，總統府發言人郭雅慧駁斥並表示，總統府日前已經表達，對於民進黨立法院黨團宣布聲請釋憲，及行政院研議提出覆議，總統皆予以尊重；並將在收到立法院咨文及行政院呈後，審慎因應、依法處理，目前並無啟動院際協調的相關規劃。
國會改革三讀後，行政院長卓榮泰表態感到遺憾將提出救濟，而現在傳出賴清德也將依照《憲法》第44條「總統對於院與院間之爭執，除本憲法有規定者外，得召集有關各院院長會商解決之」，召集五院院長會商解決國會改革爭議，不過消息傳出後，國民黨看法不同。
王鴻薇質疑，不懂賴清德所謂的院際調解要怎麼調解？五院之中如行政院長、司法院長都是賴清德的人。對立法院長韓國瑜來說，國會改革法案已經通過，不可能自己閹割立法院通過的案子。她批評，賴清德出手只是擺擺樣子，事實上根本在欺負韓國瑜，而行政院要不要提覆議最後拍板也是賴清德，而不是卓榮泰，她呼籲賴清德先調解好自己人，不要搞朝野對立。
對此，郭雅慧則表示，總統府日前已經表達，對於民進黨立法院黨團宣布聲請釋憲，及行政院研議提出覆議，總統皆予以尊重；並將在收到立法院咨文及行政院呈後，審慎因應、依法處理，目前並無啟動院際協調的相關規劃。
