馬政府第一任文人國防部長楊念祖，黯然請辭，但問題是楊念祖在國防部超過3年，才就任部長6天，便被爆料，立委認為是軍中派系爭卡位，鬥走部長，加上先前陸軍頒旌忠狀給洪仲丘挨批，國防部大動作澄清並不知情，也讓內鬥檯面化。
遺照上的這幾張笑臉，都是過去10年內命喪軍中的士兵，國防部前聚集家屬要討公道，一牆之隔，裡頭也不平靜，前一晚，部長楊念祖請辭走人，為的是2007年掛名主編的「決戰時刻」，涉及抄襲，楊念祖進入國防部超過3年沒人提，當上部長不到一星期就被爆料，時間點，立委直指不單純。
民進黨立委蔡煌瑯：「很有可能就是軍中的保守勢力，對於文人部長的大反撲，同時也是對馬總統的一個示威。」
陸軍副司令吳有明(102.7.9)：「表達最誠摯的歉意。」
7月9日，軍方第一次公開說明洪仲丘案，當時的部長高華柱不在國內，陸軍派副司令出面，層級太低引發譁然，被視為嚴明熱門接班人選的陸軍司令李翔宙，被嚴明記了申誡一次，李翔宙如果因為洪案下台，副參謀總長嚴德發可望接棒，接班梯隊排排站，空降文人部長楊念祖，無異投下一顆震撼彈。
陸軍六軍團指揮官陳泉官(102.8.3)：「洪爸爸，這是總統特別頒給仲丘的旌忠狀。」
陸軍送出旌忠狀挨批，國防部強調事前不知情，大動作切割，暗指陸軍自作主張，等於讓自家人內鬥檯面化，文人部長打亂軍系接班布局，一篇6年多前的舊文，逼退楊念祖。
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