國安局長陳明通在台大指導的論文爭議頻傳，包含桃園市長鄭文燦、前新竹市長林智堅的論文都遭認定抄襲而被撤銷。也是陳明通學生的民進黨立委邱志偉今（11）日凌晨在臉書發文，表示他2000年在台大的離校手續，僅規範要繳交碩士論文紙本，他畢業時按照規定繳交紙本畢業論文，絕無所謂173位論文不公開的說法，至今他依然相當感謝陳明通的指導，他從不忘師恩，也希望外界許多不實的影射、錯誤的傳言，皆能夠盡早結束。
邱志偉表示，這陣子外界對於台大國發所論文風波的討論，讓他回想起24年前、1998年入學台大研究所的點滴，在入學前他並不認識陳明通，他曾受業於洪鎌德、郭建中、周繼祥以及陳明通，每位老師皆是各領域的一時之選，讓他收穫非常多。
邱志偉表示，陳明通在地方派系研究上相當傑出，但同時也深耕當年還屬新崛起領域的中國研究，加上對陳明通上課內容感到相當契合，因此自然選擇陳明通作為指導教授。邱志偉指出，陳明通相當關心學生，在他撰寫論文期間，每週都必須和老師meeting，論文草稿，陳明通都非常細心提供各種修改建議，一次次的修正論文，確實也讓問題意識更明確、內容更加嚴謹，分析架構更加清晰。
邱志偉指出，當時畢業須經過2個階段，先通過研究計畫口試，也就是從問題意識到文獻回顧的章節撰寫完畢，通過口試，修改到口試委員同意後，才可繼續撰寫後續的章節，他在通過計畫口試後，窩居研究室9個月的時間，經常徹夜未眠，就直接在研究室過夜。最終才完成「90年代後期美日中三角關係之研究」的碩士論文，並以當年相當新穎的戰略三角理論，分析美日中的三邊關係。
邱志偉也回憶，2000年台灣大學的離校手續，僅有規範要繳交碩士論文紙本，並沒有電子論文的要求，經查現在的臺灣博碩士論文知識加值系統是2010年才上線，但在他唸台大研究所的年代，並沒有這樣的電子論文系統，他畢業時按照台灣大學離校手續規定，繳交紙本畢業論文，在國家圖書館皆可查詢（索書號：570 001M:2 89-3），「絕無所謂173位論文不公開的說法」。
邱志偉說，當年認識陳明通時，陳明通並無任何官職，僅是單純的台大教授，根據臺灣博碩士論文知識加值系統資料顯示，陳明通自1995年指導學生論文後，他是老師的第12位指導畢業學生，「至今我依然相當感謝陳明通教授的指導，尤其是對論文撰寫過程給予相當多建議，令我獲益良多。我從不忘師恩，也希望外界許多不實的影射、錯誤的傳言，皆能夠盡早結束」。
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