台北市長柯文哲批評中央，增設松山機場採檢站是瞎指揮，讓醫福會執行長王必勝再度反擊，直說自己很少跟軍醫體系吃飯喝酒，就因為勇於任事、使命必達，讓他跟三總互相欣賞信任，不過台北市副市長黃珊珊也批評，採檢人潮減少沒有增設必要，中央不敢把65歲以下快篩陽視同確診，就是因為藥品不足。
台北市長柯文哲(5.21)：「應該在現有的點作業容量增加，而不是再設新的點，所以不要為了設而設。」
行政院長蘇貞昌(5.21)：「中央地方一起合作，讓我們一起打贏這一個防疫的，最關鍵最後一戰。」
中央認為採檢站有擴增的必要，但台北市副市長黃珊珊也反擊，曾清楚表達台北市的策略，而且台北市採檢目前有些鈍化，急門診不見大量排隊人潮，打仗需要各方力量，絕不能讓醫護消耗戰力，現在的重點不是增加PCR，而是照顧有症狀的確診者，快篩陽如果視同確診，就不用勞師動眾做這麼多PCR，我也不明白為何65歲以下，一定要PCR才能認定確診，說穿了就是藥品不夠。
前疾管局長蘇益仁認為，應該把醫院保留做pcr，政府開設的採檢站，除了快篩，並有領藥、跟申請證明的功能，讓公衛跟醫療功能分開，採檢站該怎麼開，各方各有看法，也讓北市跟中央的戰火再度蔓延。
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