因特別費案被起訴的首長中，前教育部長杜正勝，在故宮博物院院長和教育部長任內，被特偵組認定，以個人及妻子陳芳妹私人的消費發票，核銷特別費，總共詐領36萬1366元，而他的辦公室秘書郭秀霞，明知是私人消費仍據以核銷，名目大都是購買禮品贈送貴賓，或不實餐敘等理由請領，其中檢方查到高達6萬元，是杜正勝自己的置裝費。
杜正勝之前還因為被媒體報導，兒子上夜店也拿去報特別費，氣的罵人轉頭就走，現在特偵組果然還了杜明夷一個清白，檢察官並沒有查到杜明夷上夜店報特別費，而是發現他買了一瓶2千多元的香檳，送給蔡依林的經紀人，說是要討教面對媒體的撇步，檢方姑且相信杜明夷為了老爸真是用心良苦，所以這香檳算是因公支出。
不過，杜正勝卻有其他80筆款項大有問題，其中包括一筆524元，買的明明是女裝，卻核銷要送雲科大一位男校長，但特偵組一查卻發現，雲科大根本沒有周弘昌這個人，既然是他的妻子陳芳妹刷的卡，因此難以認定是因公支用。
還有，花了18535元購買飲水機，用途是院長送許院士，不過中研院士許倬雲卻否認收到禮品，因此不符因公支出；另外，也有一筆34360元買來的服飾，理由是送給中研院許倬雲、陶晉生院士，不過又被許倬雲否認，特偵組認定，這根本是屬於首長日常支出，並非因公。
最離譜的是一筆6萬多元的西裝，核銷明目直接寫著購衣，但檢察官查出，那是首長私人置裝費，很難認定是因公支出，而這套名牌西裝也被查到，是在台北車站附近的一家百貨公司專櫃，杜正勝簽帳買單，在故宮博物院當院長和教育部長任內，檢方認定杜正勝一共貪污36萬多元，因此依法提起公訴，讓雖然已經卸任教育部長的他，仍然得面對社會公評。
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