前總統陳水扁一卸任，就被列為國務機要費案的被告，而且跟妻子吳淑珍都遭境管；2人只要出境，航警海巡就會立刻通報最高檢察署，嚴密掌控他們的出入境動態；現在又有媒體報導，特偵組檢察官吳文忠說「應該要槍斃陳水扁」；認為檢方選擇性辦案，但吳文忠說，是媒體過度解讀他的玩笑話。
記者：「總統，特偵組這樣對你，會不會覺得很委屈？」前總統陳水扁：「謝謝，謝謝。」記者：「成為境管對象，會不會委屈？」
當作沒聽到，就是不想回答；陳水扁前總統前一天才剛卸任，就隨即被列為國務機要費案的被告，現在連出入境也遭嚴密監控，和妻子吳淑珍都被列為境管通知對象！海巡：「我們確實有接到陳水扁夫婦，境管的問題，要出海的話，我們要依照規定向上通報。」
海巡單位加強安檢，就算沒有收到照片或書面資料，也能辨認出前任總統夫婦；因為禮遇卸任元首，特偵組並沒有將陳水扁公告限制出境，只發函總統府、警政署、海巡署及移民署和外交部，發現陳水扁夫婦要離境，就要立即通報最高檢察署，獲得檢察官同意才能放行。
而現在又有媒體報導，特偵組檢察官吳文忠和記者聊天時，脫口而出說「陳水扁應該要槍斃才對」，批評檢方有政治立場，選擇性辦案；但吳文忠澄清那只是玩笑話，完全沒有政治意味。
特偵組檢察官吳文忠：「那時候就突然講一個『槍斃』，嚇他們(記者)一下，他會以為我是在講陳水扁，我說『不是，是死刑犯要槍斃，或是性侵犯、殺人犯』，大家就覺得很好笑啊，說陳水扁應該要槍斃，是有心媒體自己講的啦。」
吳文忠認為被過度解讀，令人遺憾，但這番玩笑話已經引發爭議批評。偵辦前任元首涉嫌貪污的重大案件，檢方的司法動作和私下言論，都是各界矚目焦點。
