巴紐案爆發第5天，行政院副院長邱義仁終於請辭！邱義仁強調，自己的身分從「證人」變成「被告」是他請辭的關鍵，對於國家社會損失和紛擾他深感抱歉！不過到底巴紐事件，是不是陳總統下指導其，邱義仁說，總統只知道進度，對於細節不了解，他有信心司法會還他清白，他也打包票自己不會逃亡！
前行政院副院長邱義仁：「下午和張院長提出辭呈，國家社會受到這麼大的傷害，我深感自責，非常非常抱歉。」
之所以在巴紐案爆發5天後正式請辭，邱義仁說，是這個原因。邱義仁：「昨天司法的調查，身分從證人變被告，這是一個很大的不同，一個政務官是一個被告，不適宜繼續這個位置。」
邱義仁也強調，會有這個決定，陳總統並沒有下指導棋。記者：「和總統有沒有關係？」邱義仁：「毫無關係。」記者：「簡訊來和高層告知，高層是陳總統嗎？」邱義仁：「完全不是事實，我不太會使用簡訊，所以這種話 ，這段時間有太多，不是真正的事實。」
儘管要離開了，對於案情中有所謂「受賄7人名單」，邱義仁很有意見。邱義仁：「這些人兜不在一起，假如不管是我、黃部長、柯副部長，有參與其中的話，你說像那些民間的商人，我們都不認識，王廣德先生是不是，我昨天看了媒體才曉得，(可能)金先生、吳先生，有這個計畫要打點這些人、擺平這些人。」
為什麼會被騙？邱義仁說，他也很懊惱。邱義仁：「表示說我不是聰明人，他們代表代理部長來，有草約有具體進展，事情是有進展，才覺得他們不是空口說白話，沒做這些安全的查核，我必須承認這是很大的(錯)，造成今天這麼『慘』的後果 。」
承認錯誤，不過外界質疑，邱義仁和巴紐有聯繫管道，邱義仁嚴正駁斥。邱義仁：「我如果有能力和巴紐交換意見，我早就去把金紀玖抓回來，自己不用落此下場。」
要司法還清白，邱義仁也打包票自己不會落跑。邱義仁：「要還我清白，司法我非常依賴，在這狀況底下，我盡力配合司法要求，我很自信我不會逃亡。」
面對媒體，難得的有問必答，離去之前，邱義仁希望能為巴紐風波，止血多少是多少。
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