北市批發市場陸續爆發群聚，歸咎一方面這些市場場地大、人流複雜，防疫本來就不容易，另一方面北市府也被批評篩檢太慢、足跡公布不確實，還有就是中央到地方考量批發市場戰略物資意義，不敢貿然休市，恐怕都是造成疫情擴散原因。
台北市長柯文哲(7.2)：「過去都以為醫院是感染最重要途徑，結果發現醫院才30%，反而跟市場相關的更多，所以我想這也是給我們一個，跟教科書上寫得不一樣。」
連號稱醫學專業的柯市長都想不透，或許也因為這些市場，和一般你我想像中的傳統市場，不太一樣
記者劉亭廷：「萬大第一果菜市場，是全國規模最大的批發市場，但就因腹地龐大分為不同區域，採半開放式空間加上人流南北往返相對複雜，也讓防疫上增加難度。」
光是第一市場每天進出就高達將近一萬人，重點是這些人也不一定天天都在這，想追不容易，另一邊的環南，零售跟批發都有做，鄰近北農和家禽市場，出入也相對複雜又是密閉空間，先天條件防疫困難，更別說後續市府處理也被批評。
立委林昶佐(7.2)：「因為來往人員複雜所以篩檢沒辦法，最後還是篩檢了啊。」
因為在6/5中央當時就發公文，建議雙北果菜批發市場進行廣篩和普篩，但到6/9柯文哲進行三次快篩25日打疫苗，7月1日大規模PCR時間長達一個月。
指揮官陳時中：「(為甚麼爆發是因為之前沒普篩原因嗎？)各種原因都有啦，疫情這東西不是我們，人的計畫性有辦法處理。」
普篩被批慢了，還有疫調，過去一個月市府沒有公布確診者足跡，也被認為讓民眾無所適從，相比而言。
這不知是不是在反諷台北市，因為新北家禽一爆確診，侯友宜下重手休市三天，反觀中央到北市府堅持北農不能說關就關，因為還有戰略物資考量，市場成疫情破口，北市一句「沒有人是故意的」，但也或許有些太大意。
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