機師檢疫期限放寬「3+11」被認為是疫情破口。前一天陳時中才透露，會議應是由副指揮官陳宗彥主持。今天(29日)下午記者會上，陳時中證實陳宗彥其實不在會議中！政策也是由陳時中拍板認定的，對於相關決策，他會負責。
總算還陳宗彥一個清白，陳時中前一天直指副指揮官陳宗彥主持機組員3+11放寬會議，事隔一天查了資料，原來是誤會一場，但身為指揮官總得擔起責任。
指揮中心指揮官陳時中：「我之所以會回答這個是因為，邊境一向是陳副指揮官在做督導，所以那天他剛好有事，所有的這些相關在指揮中心的政策，都是由我來負。」
峰迴路轉有了答案，陳時中說4/13日的決策會議有疫情監測、邊境檢疫、社區防疫、醫療應變小組以及專家與會討論再向他報告，最後由陳時中公開宣布。
民眾黨立委邱臣遠：「陳時中部長昨天在國會上的發言，可以說是公然的說謊藐視國會，給予國會立法委員不實的資訊。」
遭批第一時間說謊，不只疫情嚴峻，外界對指揮官的質疑也沒少，陳時中蠟燭多頭燒，換指揮官的聲浪席捲而來。
國民黨立委陳玉珍：「國民黨有一直在呼籲，讓陳時中部長專心做醫療防疫的部分，那疫情指揮官的部分，呼籲讓身為副總統的賴清德來擔任。」
要陳時中交棒給別人，不只藍營點名賴清德，綠營人士也喊出前副總統陳建仁，民進黨前立委郭正亮爆料，陳建仁可能接手指揮中心，對此總統府回應，完全是無中生有憑空捏造的謠言，政院更誇讚陳時中的表現有目共睹，所謂換掉指揮官的傳言絕非事實，府院一致力保陳時中不讓防疫分歧。
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