馬政府宣示要杜絕非法監聽，現在傳出有一項新的改革，原本政府針對兩岸之間的通訊，會進行雙向監聽，媒體報導說馬總統指示，以後未來只會監聽大陸打到台灣的電話，不過，這部分相關單位還在研究中，監聽方式主要是以關鍵字跟關鍵號碼，才會存下錄音。
電影「火線追緝令」，警探監聽以關鍵字找出兇嫌，電影情節正是台灣政府監聽方式的寫照，以往針對兩岸通訊的監聽，不管是台灣打到大陸，或是大陸打回台灣，全部都會被監聽，但馬總統指示，希望朝向只監聽大陸打到台灣的電話。總統馬英九(97.05.20)：「將不會再有非法監聽。」
新方向將貫徹馬總統的宣示，監聽是一回事，真正會存成檔案又是另一回事，存檔標準主要是有兩種，第一是關鍵字，只要監聽內容有提到關鍵人名、關鍵字眼全都錄、全都存，另一種則是關鍵電話，只要政府單位辦公室電話跟公發手機的電話，使用前都會輸入監聽設備，打到大陸的電話全部監聽、存入電腦。
馬政府要把監聽降到最低程度，但情治單位有顧慮還得再研究，只是通訊是人民基本自由，一律監聽違反人權，如何取得平衡，馬政府要拿出決心。
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