指揮中心啟動政風調查彰化縣衛生局，連日來紛擾不斷，陳時中的動作遭外界質疑「政治考量高於專業」。對此，東海大學政治系副教授邱師儀在《新聞大白話》表示「根本不該從政治思考，這件事關係著台灣衛生與人民，講實話第一波時『哪個人不是順時中的？』現在面對第二波疫情，彰化透過精準篩檢，驗出陽性個案，不該當成借鏡嗎？蔡政府打著『防疫要能做好，必須靠中央地方一條心』，葉彥伯今天也哽咽表示『希望能繼續跟陳時中協力對抗疫情』，我比較不了解醫界的階層，但為何要用政風查處，難道不怕會產生寒蟬效應嗎？陳時中『應該先溝通，不該先政風』」。邱師儀也感嘆「民進黨選舉全贏了，但『社會變得好像不能有不同的聲音，哪怕是一點聲音，網路就會出現各式各樣的出征，哪有一個民主社會是不能監督的」。
另外，前衛生署署長葉金川指出「現在指揮中心好像是『聖旨』，只要有一點雜音就視為敵人，你應該要跟地方溝通，也要跟專家溝通，反對者不一定是對的，但指揮中心應該去說服防疫期間有需要跟他們為敵嗎」，他也說「現在很多人起底葉彥伯，說他有什麼利益迴避的問題，但如果要貪污，就不應該當衛生局長，衛生局長薪資很低，一個這麼專業的人，你現在把他打成落水狗，不曉得以後誰還要當公衛醫生」。
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