敦睦艦隊造成27人染疫，外界質疑明明知道有疫情，究竟是誰核定出航的？對此國防部長嚴德發責任一肩扛，說是他核定的，總統蔡英文也知情，而嚴德發也首度證實，這支艦隊曾執行機密任務，4/12中共遼寧艦繞台時，曾派敦睦艦隊監控對方的航母行動。
國防部長嚴德發：「2/20由我本人國防部核定，總統表示尊重。」
但有傳言參謀總長黃曙光才是堅持讓艦隊出航的人?
嚴德發扛責，但也首度證實這支敦睦艦隊曾經身負重要機密任務。
國防部長嚴德發：「它(敦睦艦隊)的位置剛好在南部海面，這三條船，剛好當時4/12，我想各位都記得，是中共的遼寧號航空母艦從東部外海經過巴士海峽。」
還原整個時間軸，這支敦睦艦隊是在4/9返抵左營港，4/12、13正巧遇上中共遼寧號繞台航行，於是決定就近指派敦睦艦隊監控對方的航母行動，直到4/14下船，聯檢小組實施入境檢疫，但有立委質疑，機密任務不只這樣，還涉及到其他國家，暗示這次遠航有國防部以上更高層指揮涉入。
國防部長嚴德發：「是比較機密，不方便對外說。」
事涉敏感，國防部不好說，倒是曾是三軍統帥的有話不吐不快。
軍艦染疫，也讓有些軍事機密不得不搬上檯面。
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