開工後對防疫又是一大挑戰，政府暫緩大陸人來台，面對缺貨的口罩也希望工廠提高產能，未來可能採政府統一徵購，但行政院的官員出面依然沒有戴口罩，對比北市府第一線公務員，不僅辦公桌上有酒精和乾洗手，口罩也是必備品。
北市府員工：「組長有說要幫我們買口罩、酒精。」
北市府員工：「是不是會要學google居家辦公，盡量減少會議聚集，開會是不是盡量用視訊。」
行政院發言人Kolas Yotaka：「院會裡面，那如果部會的首長，他並不是患者，那他自己也不是慢性病的患者，我們的空間也不是密閉式的空間，所以今天大部分的首長，大部分並沒有戴口罩。」
中央地方不同調但疫情擴散，現在入境管制很嚴格。
衛生福利部疾病管制屬副署長莊人祥：「禁止湖北省的陸人來台的政策，也推遲湖北省且發陸人許可證來台，陸生來台也暫緩到2月9日，還有暫緩湖北省以外的交流，及三類部分觀光的受理。」
但國內有不少民眾抱怨買不到口罩，行政院也拿出因應方案。
衛生福利部次長何起功：「希望他(口罩工廠)能夠擴充產能，如果需要的一些設備，資金的一些挹注，政府可以從旁協助，希望產能可以擴充到420萬。」
防堵役情政府從各方面著手，絲毫不敢大意。
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因應武漢肺炎疫情，疾管署持續加強疫情監測與邊境管制措施，如有疑似症狀，請撥打：1922專線，或 0800-001922，並依指示配戴口罩儘速就醫，同時主動告知醫師旅遊史及接觸史，以利及時診斷及通報。
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