監察院提出糾正案，認為最高檢察署應該考量將朱朝亮、吳文忠調離扁案，負責專案的監委李復甸今天再度強調，他們不質疑朱吳兩人辦案的熱情，但是私下與扁通話見面，的確已經違反了檢察官守則；不過前立委謝啟大看到這樣的結果卻相當憂心，直闖李復甸辦公室，說兩位檢察官是好人，監院這樣子是中了被告的離間計。
不管朱朝亮、吳文忠兩位檢察官，有沒有被設計陷害，監察院認為，他們的確是做了不對的事。
監察委員李復甸：「以8月18日這天為例，成功的通聯7次，這個時間加起來超過半小時，這兩個私下接觸陳水扁的事實，這兩個人都不否認，不管他說他是被陷害的、被什麼的，事實存在，我們只管事實，所以我們對於這個事實提出來，我們認為說，有這樣子的情況，他就不適合再辦這個案。」
強調對事不對人，朱朝亮吳文忠私下與扁通話、見面，已經違反檢察官守則，但監察權屬於事後權，扁案相關部分案件仍在偵辦中，此時提出糾正案，外界質疑時機不恰當。
李復甸：「我們一直等到一個適合的時間，對於司法衝擊最小，或是沒有衝擊的時間把它提出來，那我們提出來，就是案件那部分已經起訴、已經審理，然後它第二部分，譬如說是二次金改、譬如說是機密外交，那些東西都還剛剛開頭。」
監察院態度強硬，但有人還是不能接受，前新黨立委謝啟大就直闖監察院，說朱朝亮跟吳文忠都是好人，監院此舉恰好中了離間計。前立委謝啟大：「他們在偵辦案子上的認真，他們不可能被金錢收買，被告最希望的是，把這些瞭解案情，又不被收買的檢察官換掉嘛。」
就算說瑕不掩瑜，但監委認為，司法獨立，已經無人可管，如果連監察院都不站出來，被告或受害者還能倚賴誰。
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