這次榮總這麼大的反彈，不僅讓退輔會相當意外，也讓外界再次質疑，是不是台大、榮總，門戶之見始終未解？其實，雙方在前年才剛展開合作交流，榮總醫師私下抱怨，合作研究當然沒問題，但空降個院長來「管他們」，一反過去從院內挑人才的制度，才讓他們不滿。
時任台大醫院院長林芳郁（96.4.4）：「台北榮總各科部的老師，跟台大醫院的老師，都是好朋友啦。」北榮院長李良雄（96.4.4）：「今後是兄弟同心，其利斷金。」
前年台大、榮總首度展開合作，成為話題，真的就此打破50年來的藩籬嗎？從老蔣時代，蔣家就開始在退輔會系統、軍方背景的榮總就醫，儼然成了總統御醫，國民黨色彩濃厚以外，也造就歷任3任總統的心血管權威姜必寧。
只是到了李登輝當總統，不但改到台大就診，接任的陳水扁和台大關係更好，總統醫療團召集人陳楷模名號響亮，台大、榮總，藍綠似乎壁壘分明。前榮總院長羅光瑞：「我坦白地講，榮總大概都是支持泛藍啦。」
不諱言真的很藍，這回總統大選當然投馬，但就算林芳郁是馬總統建中同學，還有多年友情，要台大人來管榮總，這已經不只是藍綠問題。前榮總醫研部主任韓韶華：「打破門戶之見是很好，但各位都知道，榮總並沒有太深的門戶啊。」
即將卸任的院長李良雄，其實北醫畢業，可是在榮總待了36年才升院長，一向從院內挑選人才，為何得在這次破例空降？榮總人的大反彈，再次挑起台大、榮總的瑜亮情結。
