二次金改宣判陳水扁無罪，特偵組將持續上訴，更有所指的說，法官應該摒除個人意見，做出公正判決。判決書裡，雖然認為總統職權和二次金改沒有直接關係，不可能行賄，也無法證明各大企業家「進貢」的錢是不法所得，因此判決無罪。但是審查至今，不少企業家無奈表明，捐錢給扁家都不是發自內心，這些供詞法官似乎省略跳過。
二次金改案，21名被告，一審宣判全部無罪，星期天特偵組罕見舉行開記者會，決定繼續上訴。特偵組發言人 陳宏達：「我們對於他法院法官相關的論點，檢方立場是表示無法接受，這裡當然包括他對於總統職權的詮釋，以及相關事實的認定。」
判決書寫了，在兩大併購案裡，都無法證明總統職權有直接關係，因此判無罪，但二次金改之後，金控業者認為政策影響事業版圖，也為了經營官邸關係，送錢進入扁家探尋官邸意見。
中信金辜仲諒曾說過，總統跟夫人要求的2億，是不樂之捐；辜仲瑩也說，以我們的行業來說，官方實在得罪不起；元大馬維辰也說2億給吳淑珍，純粹買一個心安；金控業者吐露心聲，為了暢通高層，只好花錢處理。
有目的的掏錢，還不算賄賂？特偵組，認為法官審判要屏除個人意見。陳宏達：「當然要排除自我的專擅、恣意還有率斷，這種種內在的獨立，也是很重要的。」
認為掏錢給扁家的心聲，法官沒聽見，金改案一審21人全部無罪，引發討論。
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