這次九合一綁公投選舉，堪稱史上最複雜，以六都選民來說，有市長、市議員、里長選舉外，還有公投票一共13張票，導致投票時間拉長，有民眾從排隊到投完票花了一個小時，民眾也說最耗時是在排隊等公投。
民眾：「要排隊，很擠喔裡面。」
因為這回選舉，從進到投票區後，先投九合一大選，接著才是公投，如果不領公投票也可先告知。但以吳敦義為例，從10點03分開始排隊，花了46分鐘才進到投票區，但這還只是剛開始。
國民黨主席吳敦義：「程序延長，還要多蓋好多章，當然時間會延長。」
民眾從踏進投票教室後開始計時，投完市長議員里長票，就花了7分鐘，接著再領公投票，有得排隊等等等，過了12分才完成投票，加上排隊時間，每個人最快也要一個小時。
民眾：「(排隊會很等久時間嗎)，還可以啦，(哪個環節花比較久時間)，等公投時間花比較久，我大概9點10分就到，但是前面排隊就已經排很久，裡面其實可能有公投關係，大家會投的時間會比較久。」
如果是六都選舉，每位民眾要先領3張票，如果是其他13縣，則要領5張，加上公投還有10張，導致投票時間拉長，民眾在下午4點前可抓好時間，前往投票。
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