經過數小時的討論，行政院長吳敦義命令六輕工廠停工，查明釀災原因，並進行改善，確定安全無虞後，才能復工；而停工命令是否會對石化股造成影響，就看禮拜一的開市情形。
六輕大火燒出民怨，行政院長吳敦義今天南下實地瞭解情況，晚間7點多命令六輕停工。
行政院長吳敦義：「今天就雲林縣麥寮台塑六輕工廠煉製二廠發生火警，地方民眾、縣長、鄉長、議員、村長、村民，都非常關心，所以同地方代表與台塑集團負責人，共同經過幾個小時研商和熱烈討論，達成幾項具體共識，分別去執行。
第一，此次災變，雲林縣環保局及勞委會中區勞動檢查所，均已對台塑六輕煉製二廠命令停工檢查，詳予查明釀災原因，並多處確實改善，務經徹底檢查，確認安全，符合規定，始能復工。
二，農漁畜產損失，由縣政府邀集鄉公所、業者，推派專業人員，會同勘查實際受損金額，辦理補償。
三，鄉公所要求業者，提供麥寮鄉及台西鄉鄉民，免費健診，就是健康檢查，業者同意辦理。
四，原定縣府消防局會同中區勞檢所等有關專業人員，於本99年8月5日，到現場辦理火災原因鑑定作業，應蘇縣長要求，延緩1天，在8月6日辦理。
五，勞委會中區勞動檢查所於7月29日，已會同勞工安全衛生研究所人員，辦理檢查，正撰擬災害檢查初步鑑定報告，並請業者於一週內，提出災害原因初步調查結果，及改善對策報告書，視上列報告書提出後，同意蘇縣長建議由勞委會邀請縣府及勞委會，共同推薦之專家學者審查並探究原因，及具體可行之改善對策，以確保未來安全無虞。」
