這回地震受災的地點，如果從地圖上標出來，位置都在「米崙斷層」上，因此專家認為，很可能就是米崙斷層錯動導致這次地震。氣象局也表示這回光是前震就有近百個，主震後又有大小餘震不斷，很不尋常，甚至不排除會觸發更大地震。
在7點11分的時候，又有一波規模4.5的地震發生，也是在這個附近，而且深度只有5公里，也是一個極淺層地震。記者在連線時，碰巧遇到餘震，救難隊員三步併兩步遠離倒塌的雲門翠堤大樓。
從4日開始花蓮就地震頻傳，原本以為主震已經過了，沒想到6日晚間，規模6.0的地震才是主震。
地震專家陳宏宇表示雖然這次也在外海，但外海的部分跟米崙斷層的延伸，有連結起來的關係。有專家揣測，米崙斷層錯動導致這次主震機會很大，因為這回出事的七星大橋、國盛六街、雲門翠堤大樓、統帥大飯店以及花蓮大橋，都位在米崙斷層帶上，距離震央也很靠近。
氣象局也說去年是地震安靜年，沒有規模6以上的地震，可能導致今年地震規模較大，但這回餘震著麼多，氣象局也認為不尋常。
地震測報中心技正汪準熙說觸發一些小的地震來平衡，要等到1、2個禮拜以後，這些餘震活動才會慢慢地歸於平靜。
造成這次傷亡，除了震源淺，餘震一波波，也是主因，算一算，從4日開始的前震就有95個，加上主震和餘震，累積達到200多起，餘震不停歇，氣象局也表示受到餘震影響，不排除可能會誘發其它更大地震，假如發生，預計會集中在這次震央附近。
氣象局說除非有更大的地震發生，否則6.0這波應該就是主震，但花蓮本身就位在斷層帶上，提醒民眾得隨時做好防震準備。
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