頂新飼料油案彰化檢方偵查終結，起訴魏應充等6名被告，其中對魏應充依5項罪名，採一罪一罰，建請求刑30年，最關鍵的就是魏應充到底對進口飼料油知不知情，起訴書中寫道，魏應充知道公司成本壓力，即使幕僚告知越南豬油、牛油、椰子油檢驗報告，脂肪酸組成與CNS不符，他明知有問題，還是主持會議做成決策，指示繼續採購，而大幸福公司因此每次以兩百萬越南盾，等同台幣三千元的代價，買通越南當地一間檢驗公司，作假的檢驗報告，讓飼料油以食用油名義報關出口。
魏應充羈押看守所13天，檢方起訴，採「一罪一罰」，他共涉及詐欺60次、加重詐欺79次、販賣攙偽罪3次，求刑30年。而起訴最關鍵點在於，魏應充到底對公司進口飼料油知不知。
起訴書寫，魏應充知道公司成本壓力，即使幕僚告知越南豬油、牛油、椰子油檢驗報告，脂肪酸組成與CNS不符，明知有問題，還是指示繼續向大幸福公司採購油品。
彰化地檢署襄閱主任檢察官黃智勇：「豬油部分會添加一家傑樂公司的豬油，牛油的部分就會添加澳洲牛油，讓油品品質穩定。」
檢方兩度提訊魏應充和在押被告，發現從民國99年，頂新向大幸福公司進口飼料油，隔年因為價格上漲，為了節省成本，常梅峰要求楊振益，將飼料油以食用油名義報關出口。
楊振益找上越南VINA CONTROL業者，以每次兩百萬越南盾，折合台幣三千元的代價製作假報告，後來常梅峰因為大統長基混油案去職，接替的陳茂嘉繼續這麼做，而魏應充也都看到大幸福檢驗報告，卻不阻止。
起訴書陳述，魏應充主持糧油會議做成決策，對查廠報告不合格也一清二楚，卻瞎掰說沒聽過大幸福公司，另外針對魏應充利用檢察官彙整事證，向法院聲請搜索之時間差，特地於假日回到辦公室，還在轎車車廂內藏匿簽呈等資料。
檢方將魏應充依5項罪名起訴，罕見的建請求處30年，並沒收頂新公司不法所得4億4千多萬元。
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