隸屬科技部的海研五號研究船，9日從安平港出發，執行環保署研究計畫，因為海象不佳，(10日)晚間5點多在澎湖外海失去動力，整艘船沉入海中，海巡署、國防部獲報後，船上45人陸續被救出，但不幸的是，有兩人到院前，沒有生命跡象。
搜救人員從船上扛下擔架，好不容易從澎湖外海，救回海研五號上的研究成員。海巡人員：「小心、小心，他右手骨折喔。」
船員手部骨折，腳上受傷，怎麼會發生船難，船員們全身癱軟，嚇得說不出話來。記者：「請問一下當時狀況怎麼樣？」船員：「…。」
當時這搜隸屬科技部國家實驗研究院，國內最大的海研船海研五號，啟用才兩年，竟然發生意外。
海研五號船員：「澎湖外海的時候，突然聽到船殼很像有撞擊一些東西，之後就聽到船員說，機艙已經進水，就請我們到甲板等待
海研船9日上午9點從安平港出發，要進行為期八天的海上作業，10日預計要抵達馬祖，但海象太差，在澎湖外海準備折返，沒想到下午5點多，疑似觸礁，船艙開始進水，9點多就在龍門外海處沉沒。
海研五號船員：「聽到『扣扣』的聲音，就感覺船是沒有動的感覺。」
事發當時，又急又快，船隻突然失去動力，海巡艦艇立刻出動救援，但當時海象差、霧氣重，夜間搜救困難，出動國軍艦艇，搜救直升機運輸機，加入救援直到深夜，萬幸的是，海研五號裡45名船員深夜陸續被救起，18人輕重傷，但其中2人送醫後不治。
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