學校的招生廣告引發糾紛。嘉義一名吳同學投訴，他高中就讀台中私立嘉陽高中，當時是因為看中學校的招生廣告，打出只要通過本校測驗就保證取得斯洛伐克康明尼大學醫學院的錄取通知，但他唸了3年書，繳了200多萬學費，取得了畢業證書，卻沒被錄取，質疑自己的權益被暗槓了。對此校方強調是學生沒有通過斯洛伐克醫學院的入學測驗，沒有黑箱作業。
台中市私立嘉陽高中「醫科留學班」招生，打出3年後通過本校測驗保證取得斯洛伐克康明尼大學醫學院錄取，但已經畢業的校友投訴，他唸了3年的書，花200多萬，學校最後卻以沒有通過入學考試為藉口淘汰他。學生：「我們進去的時候，他沒有說要考試，他只有說要通過本校測驗，但是在我高二時要有一個考試。」
學生就讀歐洲醫學院夢碎，一狀告上法院，控告學校詐欺、背信，但校方強調，是學生自己沒通過斯洛伐克醫學院校方的入學考試，他們沒有黑箱作業。校方：「高檢署的部份，也對學校判獲不起處處分。」
校方表示，吳同學沒通過康明尼大學的甄試，還拜託學校調整成績，被學校拒絕。校方當時提出多項輔導方案，但吳家並不接受。對此，教育部中部辦公室認為嘉陽高中醫科班「保證就讀」廣告宣傳不妥，已經要求該校修正。
但吳家認為，他們每學期繳30多萬註冊費，比一般私校學費貴了近10倍，就是想要讓孩子出過念醫科，3年下來，多繳了140萬學費，醫師夢卻一場空，要學校退還溢收的學費。
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