鳳凰颱風帶來的豪雨重創北台灣交通，多處軌道積水導致台鐵北迴線中斷，花蓮北上的自強號列車被迫折返礁溪車站，乘客不得不冒雨步行15分鐘至轉運站轉搭客運。另有一列自強號從南澳站「原車倒行」返回花蓮。此外，聯合航空從東京返高雄的航班也因颱風停飛。
大雨造成鐵路積水，許多旅客被迫滯留在礁溪車站，帶著大包小包的行李進退兩難。一位受影響乘客表示，因為積水過不去，台鐵只安排他們回來轉車。另一位乘客則抱怨不熟悉當地，詢問服務人員在哪裡可以搭車。
從花蓮出發的自強號列車行駛到福隆時，因猴硐地區淹水無法通行，車長宣布折返回礁溪車站。旅客們只能冒著大雨步行15分鐘到轉運站改搭客運，全身濕透。一名受影響旅客不滿地表示，台鐵應該說清楚狀況，並為行動不便的人叫計程車，而不是讓所有人步行。
另一位受影響旅客分享了他的艱難旅程，從光復要外流時已經遇到中斷，他已經從汽車轉火車，現在又要轉回客運。
鳳凰颱風外圍環流與東北季風共同影響，造成新北、宜蘭、花蓮等地區雨勢滂沱。傍晚5點多，自強號283車次從花蓮行駛到宜蘭南澳站後停止前進，因為前方道路受大雨襲擊，有兩處鐵軌積水。部分乘客在南澳站下車，其餘的則「原車倒行」回到花蓮。
除了鐵路，航空交通也受到嚴重影響。11日晚間，一位網友拍下從東京返回高雄的聯合航空宣布停飛的情況，旅客眼睜睜看著行李被運下飛機。據了解，聯合航空表示因天災因素不會退費，也沒有安排旅館或接駁車。而國內航線方面，立榮、華信航空都已宣布12日國內線航班全線取消，並表示會視天候狀況進一步調整。
