全台滅「頂」行動，連大專校院的產學合作都開始了，台大、政大等都將不再接受頂新集團的獎學金，政大認為，一直以來教導學生要重視企業倫理，良心比錢重要，將與頂新討論停止一年75萬的獎學金，台大的食科所也終止產學合作計畫，強調要用最高道德標準來面對，但有部分學生不太贊成。
台大食品科技所的研究室裡，學生還在進行實驗工作，過去頂新集團提供學生獎學金，現在所方決定中止。台大食科所長游若萩：「台大食科所是屬於社會的一個部分，我們對於社會也是有責任，那如果說在這個節骨眼，我們還再接受企業捐款，認為是說台大應該用高道德標準，所以我們把這獎學金給終止掉了。」
獎學金過去全額共60萬，一次可領2年，共有6個名額，契約明定學生有義務到頂新集團工作，服務2年，期間薪水照領，現在台大食科所不要了，原本提出申請的10名學生暫緩。
政大商學院與頂新的產學合作也喊卡，全額獎學金一年60萬，7人，部分獎學金一年15萬，6人，都要取消。政大主秘李蔡彥：「學校裡面對企業倫理是非常注重的，我們也希望我們合作的對象也是非常重視企業倫理，我們不會強迫學生(拒領頂新)，還會幫助他們領其它獎學金。」
台大食科所學生：「尊重系上的做法，60萬(獎學金)當然很重要，而且還有工作的機會，這工作機會對往後的學習是很有幫助的，我覺得是兩回事。」
北科大跟高餐大對於抵制獎學金持保留態度，認為要讓學生自由選擇，不該由校方決定。
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