中科院的職員廖唯懿在3號深夜，身穿海軍上校制服，出現在總統府前抗議群眾中，引起爭議。民進黨立委拿出廖唯懿廣發給立委的論文，表示他1年多前曾經多次到立委辦公室，求官不成，才會有這樣的行為。中科院已經將廖唯懿記一支小過，這樣的處分，綠營痛批中科院大事化小，藍營則罵中科院濫罰。
中科院職員廖唯懿穿著海軍制服出現在中正紀念堂抗議人潮中，這一幕讓民進黨想起廖唯懿曾經多次上門求官， 廖唯懿事後被中科院記小過，這樣的處分，朝野立委看法不同。
民進黨立委陳忠信：「不斷的找我，拿著他中科院的報告，一直要我們安排，他跟當時國安會的秘書長邱義仁、當時國安部的副部長康寧祥做簡報，然後說他這個升等沒有過，表示不服，很顯然，對於這種因為求官不成，而作報復的這種行為，我們認為是作為一個軍人，非常可恥的一件事情。」
民進黨立委李文忠：「這位廖先生所犯下的第一個，叫做參加政治的非法集會，第二個叫做著上海軍上校服，自稱現役海軍上校，犯了這三個錯，你記小過，包庇到這個地步。」
國防部副部長陳肇敏：「這個規定不是因為他(廖唯懿)來修訂，是之前就已經有了，只要這個規定不合適，應該由中科院來修訂。」
國民黨立委盧秀燕：「廖唯懿在參加集會之前，他難道不知道他會被處分嗎！他難道不知道他的飯碗會不保嗎！但是他為什麼敢挺身而出，因為他看不下去了，所以扁政府，不要恐嚇軍人。」
原本國親立委以為廖唯懿會遭到免職，因此打算邀請他出席委員會，但一聽到處分是記小過，就打消了這樣的念頭。
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