在美訪問的立法院長王金平要求美方和國防部必須就潛艦的售價重新報價，也讓被認為價格偏高的軍售案，再度萌生變數，不過根據了解，台灣向美國購買潛艦的價格確實偏高，相同等級的潛艦，台灣要花費10多億，像是南美洲的智利卻只要2.5億。
美方提出的潛艦造價到底合不合理？朝野立委罕見地立場一致全面反彈，攤開價目表，每艘潛艦造價，成本加上作業和彈藥費大約為12億元，如果加上國造的支出部分，平均每艘增加為將近15億元，和其他國家接近的機型相比，以同樣在亞洲的南韓和印度比較，貴了將近5倍，價格最低的智利一艘2.5億元，最高的葡萄牙5.46億，也比台灣的便宜三分之一。全球防衛雜誌社經理鄭繼文：「我是覺得價格貴得離譜，就我們鄰國日本最新的潛艦，親潮級潛艦做一個有趣的對比，我們知道日本武器裝備是全世界最貴的，親潮級潛艦外界一般的計算最多不會超過5億，在這個情況下，軍購案對台灣是很不公平。」
美方認為潛艦國造會大幅增加造艦的成本和所需的時間，還且會引起大陸不滿，但部分立委卻認為可以增進中船的製造能力，同時可以讓海軍的造艦政策永續經營，雙方檯面下的暗自角力浮上檯面，還是拉鋸不下。
