TVBS曾經獨家為您報導，保衛總統安全的玉山警衛室內軍警混雜所引發的衝突。事實上這樣的紛爭還讓總統夫人吳淑珍介入了國安局特勤中心的事務。根據TVBS所掌握的獨家消息指出，警職的安全隨扈為爭取特勤加給，請出吳淑珍向國安局反應，還由國安局的局長親自說明，吳淑珍才沒有後續動作。
總統警衛室內軍警雜混的情況從前總統李登輝開始，到了陳水扁總統軍警比例差距更大。由於彼此養成訓練、人事升遷完全不同，因此各成派系，其中同工不同酬的情況引爆了彼此潛藏的心結。
前特勤中心執行長彭子文：「警察人員他看到跟軍方平衡以後，他覺得他那個超時津貼是警察（警政署）給的，跟你國安局沒有關係，總統警衛室的軍職他是待衛室的人，你既然國安局給待衛室的人，你為什麼不給我警政署的人？所以他（警職隨扈）也要一份，那待遇又會產生差別，變得會永無止盡，甚至於永遠沒完沒了。」
這起衝突主要是警職的特勤人員領有警政署發給的1萬多元的超時津貼，因此國安局特勤中心就以特勤加給為名目，發給軍職的特勤人員，以拉平彼此薪資差距；而警職人員則要求比照辦理，甚至驚動總統夫人吳淑珍出面向國安局施壓。
前特勤中心執行長彭子文：「因為扁嫂不了解嘛，因為有人向扁嫂等於是咬耳朵嘛，因為扁嫂不了解實際狀況，經過我們安全局局長親自出面向扁嫂說明以後，扁嫂非常識大體，所以這件案子就不了了之了。」
保衛總統安全的特勤隨扈人員，在危急的時刻甚至要以肉身為元首擋子彈，但是彼此卻因為金錢擺不平，不僅驚動總統夫人以及國安局長，而這種子彈比不上銀彈情況，更讓人為元首的安全捏把冷汗。
