公投立法今天（27日）下午4點50分展開朝野對決，首先登場的是蔡同榮版本是否需要撤回，在藍軍掌握人數優勢的情況下，經重覆表決，立院以兩度95票贊成、113反對、1人棄權，少數不通過；換言之，藍軍以席次優勢讓蔡同榮版納入待表決的五版本之一，留待表決，迫使綠軍必須在蔡版與政院版本間，做出選擇。
立院下午針對公投法修正條文進行逐條表決，首先就是最受矚目的第2條修正版本，蔡同榮版本的國旗國號領土變更，以14票贊成、175票「棄權」的罕見情形遭到否決，綠軍立委紛以棄權方式迴避做出選擇；緊接著由台聯提案的領土變更部分版本，也以13票贊成、108票反對、85票棄權的結果，少數不通過。
接下來由民進黨提案，在第2條版本中加入「制憲」字眼與國安議題列入公投適用範圍，藍綠展開激烈攻防，最後在國親黨團的強力動員下，以95票贊成、115票反對、1票棄權少數不通過。
至於無黨籍聯盟修正案，主要是將原住民族投票權益納入公投，但表決結果是99票反對、79票棄權，在朝野一致不支持的情況下，也未能闖關成功。
今日表決最為關鍵的國親第2條修正版本，最後關頭排除了任何有關國旗、國號、領土變更議題，適用事項屬憲法修正案之複決，公投主管機關由行政院（全國性公投...政院版是中央選舉委員會）、地方政府（地方性公投），形成了一份無正、負面表列的提案版本；表決結果仍由藍軍穩住人數優勢，以113票贊成、94票反對、2票棄權成功過關。
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