受巴威颱風影響，東琉線航班宣布9日中午至11日全面停航，8日一早即湧現大批回程人潮，天團玖壹壹原定四天三夜的小琉球行程也被迫縮短，提早一天返台；東部航線同樣於8日下午停航，綠島旅客搶搭末班船離島，外國遊客行程被迫喊卡。
8日清晨東琉線碼頭出現大批人潮，旅客紛紛提前返台，其中天團玖壹壹成員春風與洋蔥也在人群中，兩人一前一後下船，原定四天三夜的旅程因颱風來襲而提早一天結束。東琉線已公告9日下午至11日全面停航，儘管行程受到影響，洋蔥仍熱情回應現場粉絲的道別。
除了東琉線，綠島船班也於8日下午開始停航，不少旅客提早結束行程返回本島。有韓國旅客表示，這次潛水行程順利完成，但得知颱風即將來襲的消息後，便決定提前回程。另有綠島旅客提到，自己運氣很好剛好結束行程，但也擔心颱風對綠島造成影響，因為當地沒有屏障保護。
旅客們搶搭綠島回台東的最後一班船，由於巴威颱風接近台灣，東部航線停航至11日。除了旅客大包小包緊急返台外，一批民生物資也趕在停航前送往綠島，一箱箱貨物堆疊起來送上船隻，以免颱風影響多日造成當地居民生活不便。有綠島居民表示，回去就是要守護家園，因為每次颱風對綠島都有一定程度的影響。
在台東富岡漁港，平時周邊停車位一位難求，但為了防颱，漁民已將漁船與竹筏特地停上岸。漁民們加緊進行防颱準備，除了將漁船利用繩子綁緊靠攏，有些甚至直接吊上岸，暫時停放在馬路邊，底部也利用廢輪胎墊底緩衝。有漁民表示，與其綁著冒險，乾脆整艘船吊上來比較安心，不用整天顧船。由於漁船維修費動輒高達百萬元，漁民們不敢小看巴威颱風的威力，就怕噩夢再次上演，連忙趕工完成防颱工作，也提醒民眾在颱風來臨前應提前做好防颱準備。
