黃金蝙蝠是台灣特有的蝙蝠，主要棲息在雲林縣水林鄉，是當地重要的生態指標，黃金蝙蝠每隻每晚可以吃掉上千隻昆蟲，具有強大的食蟲能力，可以幫助農民控制害蟲，減少農藥的使用；連排泄物可以作為肥料，許多國家的農民都會運用於農業上，是農民的好朋友。
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林業及自然保育署南投分署透過專案計畫及社區林業計畫，與台灣永續聯盟在黃金蝙蝠生態館及周邊社區長期進行黃金蝙蝠保育教育推廣、調查、救傷收容及棲地營造等工作，黃金蝙蝠生態館是臺灣第一所以蝙蝠保育為主軸的自然旅遊場館，自104年度起完成蝙蝠生態保育推廣達11萬人次，環境教育推廣解說員及蝙蝠保母培訓80小時、蝙蝠照護救傷後送與收容處理231隻。
林業及自然保育署南投分署分署長李政賢表示，蝙蝠是國土綠網盤點重要的物種，也是農業地景的生物指標，鼓勵農友申請綠色保育標章，避免使用農藥，以維護生物多樣性。
黃金蝙蝠生態館館長張恒嘉表示，黃金蝙蝠數量正在減少，其減少的原因研判可能與棲地破壞、農藥汙染、棲樹砍伐、光害和地景改變等有關。農村地景的棲地保育是你我可以共同參與的方式，現在正是黃金蝙蝠的育幼期，各公司團體學校民眾，可利用黃金蝙蝠生態館官網去預約「幸蝠」的活動，共同來認識及參與金黃鼠耳蝠保育。
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