花蓮7.2強震後，截至上午11點，主震加上有感餘震，已經發生345起，有花蓮民眾就說，幾乎是每10分鐘就震一次，搖不停頭很暈，都不知道怎麼睡覺。對此專家說，可以借鏡921地震的經驗，當時餘震有一萬多個，這次餘震可能會持續半年。
台大地質科學系教授陳文山：「它的餘震上來講會維持一段時間，例如說我們就用921當例子的話，921的地震之後餘震大約會有一年多的時間，而且它的餘震數量，大概會有一萬多個非常多。可是我想我們才過一天對不對，有300多個的這個餘震來講，基本上數量上來講，大概是平均的數量。」
專家說有餘震很正常，地震中心也統計，主震加上有感餘震，截至4/4上午10點55分，顯著有感100起，小區域245起，累計總數345起。
地震測報中心主任吳健富：「就921的經驗，包含這些小的餘震，就規模3以下2、1這些餘震，它的一個持續的時間，有可能到數個月到半年之間。」
雖然能參考921經驗，但0403發生在海域，921在陸地還是有不同。
地震中心說，規模4到5之間餘震，預計這個月或最快十幾天，數量就會遞減到接近背景值。
中央大學應用地質研究所教授李錫堤：「比較需要擔心的是更外海，我們花蓮外海一直往外延伸，差不多300公里，整個都是這個所謂的海溝。海溝的地震，那整條斷層這樣子，300公里左右這樣長度去錯動，那(地震)規模都在8以上。」
未來要擔心更大的海溝型地震，但這回大家討論，7.2強震有六個區域沒收到國家級警報，包含桃園、新北、台北、基隆、高雄、桃園和屏東九如，震度都在4級以上。
地震中心解釋，東部海域相對地震站比較少，導致預判發生落差，警報範圍未涵蓋，後續會持續檢討改進。
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