屏東小琉球水上活動業者近來發現，漁福漁港附近海域，有整排珊瑚礁被刮出白白的傷痕，還有大塊的珊瑚直接被撞斷，海底珊瑚礁大範圍創傷，保育人士質疑，是縣府在漁港進行消波塊吊放工程造成。屏縣府海洋所表示，已要求包商先行停工，等待調查出損害原因之後才能復工。
當地海洋保育人士指出，這次小琉球珊瑚礁受創位置，與先前海底供水管線險遭挖斷的差不多，質疑是漁港工程造成的破壞。他們表示，珊瑚受創的範圍長約100公尺，寬約2公尺，種類則有軟珊瑚、白邊珊瑚，以及鹿角珊瑚等，看到這些生態傷痕，他們表示很心痛，希望相關單位在進行海底工程時，能慎重使用機具。
不過，小琉球漁會表示，
屏東縣府呼籲所有工程承包商，進行海底工程時，應該慎重考慮生態環境的保育，以免造成損害。屏縣府海洋所表示，已要求包商停工，等調查出損壞原因後才能復工，而且儘量在風平浪靜情況下施作，以免珊瑚礁岩受到破壞。海洋所強調，他們會繼續監督工程進行，
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