台灣缺藥問題嚴重，除了退燒止痛藥，像是第一線抗生素「安蒙西林」，以及軟便劑（氧化鎂）都缺貨。根據醫師公會全聯會資料顯示，缺藥有131種，是30年來首現。對此，食藥署表示，目前多數品項於農曆春節前後即恢復正常供應，也有其他替代藥品可以使用。食藥署藥品組科長楊博文表示，像是氧化鎂錠劑，廠商春節後已經大量生產，一個月可產三千萬劑，後續會陸續分配到臨床和藥局端。
最近台灣缺藥問題嚴重，不少藥物短缺，第一線醫師甚至形容，台灣的缺藥困境已經是國安問題了，如同讓醫生上戰場，卻沒有武器殺敵。而食藥署表示，日前接獲中華民國醫師公會全聯會提供缺藥品項時，已即刻清查各品項之供應及替代藥品資訊。經清查，多數品項於農曆春節前後即恢復正常供應，也有其他替代藥品可供使用，。
針對近期短缺的藥品品項，食藥署表示，多項為輸入藥品，其短缺原因為國外生產供應問題所致，而造成全球缺貨，例如含Frangula及Sterculia成分瀉劑、Lansoprazole口溶錠等，食藥署已尋得替代藥品，並公布供臨床端參考。另針對近期因呼吸道疾病增加所需Amoxicillin單方抗生素等藥品，也協調國產業者增加生產供應，以滿足臨床需求。對於國內確實有短缺疑慮的藥品，例如氧化鎂錠劑，食藥署已於111年12月核准專案製造，廠商自春節後已大量生產，後續將陸續分批供應，以緩解臨床端需求。
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