台北市長柯文哲接受廣播節目時漏透，自己日前開會才知道，有一批莫德納疫苗被放到過期，主因就是中央疫苗政策一團亂才導致如此，更批指揮中心指揮官陳時中「本來就沒有專業」，對於陳時中否認，表示目前沒有莫德納疫苗過期銷毀的狀況，是有11萬劑莫德納在12月21日到期，其中北市約1.7萬劑、新北市約3萬多劑，會積極調配消化，強調指揮中心負責協調和業務，「至於專不專業，目前都執行的很順利，一切都朝目標一步步進行」。
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陳時中今（15）出席社會福利及衛生環境委員會，被問到柯文哲稱有一批莫德納疫苗被放到過期，此事是否為真？陳時中說，沒有吧，目前是知道有11萬劑莫德納在12月21日會到期，台北市約1.7萬、1.8萬劑，新北有3萬多劑，新北市剩餘量比較大，但因新北市前段時間有幫忙消化疫苗，所以中央也有在配合調配，希望不要過期，但沒有莫德納疫苗過期銷毀的狀況，現在就希望大家積極打。
另外，柯文哲在廣播節目上談論中研院染議案時，也質疑指揮中心防疫專業，他指出，這一聽就知道不是被老鼠咬的，指揮中心後面那排都是我的前同事，都是都同一批老師教的，怎麼會做出那些決策？真奇怪，怎麼會政治凌駕專業？」
被主持人王淺秋追問柯「那陳時中呢？」柯則回說，「他是本來就沒有專業」、「這不是他的專業」。
被問及柯文哲的說法，陳時中先笑了一聲，強調調配疫苗是物流專業，如何施打是專家委員會做判定，指揮中心負責協調和業務，「到底有沒有專業，到現在都執行的很順利，一切都朝目標一步步進行」進貨量有時高高低低、有時過多、有時過少，但都一一克服困難，努力去做。
指揮中心發言人莊人祥說，到期的莫德納疫苗都已經使用完畢，除了接種以外也有一些少數給實驗動物施打。
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