中研院實驗室內的門把和桌面都有驗到病毒，代表環境確實遭到汙染，但專家質疑P3實驗室採高規格，照理來說環境中不應該有病毒，而且操作人員都有穿防護衣，離開時又要如何把病毒帶出，甚至負責人沒再向上通報，也讓隔離作業慢半拍，哪個SOP環節出錯，疑點多都得一一釐清。
以往P3實驗室內也有做過愛滋病、結核病這類高傳染性的實驗，但高規格的流程理論上實驗室內環境是乾淨的，因為病毒被鎖在安全操作櫃中，且人員離開實驗室都要打開紫外線消毒，而且實驗室人員都有穿防護衣，又要如何把病毒帶出且染疫，更關鍵的是負責人沒有再向上通報女研究助理曾被咬傷，恐怕讓隔離作業慢半拍。
實驗過程不能大意，通常都會兩人一組，如果實驗中病毒不小心潑灑出來，需通報另一組人員來清理，按程序脫除防護衣並沖洗，基本上病毒不會留在環境中。
台大檢驗醫學部副主任張淑媛：「脫實驗衣的狀況其實是比較危險的，(門把和桌面出現病毒的原因)就是感染了，不小心打噴嚏咳嗽的時候，不小心摸到，至於裡面未來怎麼改善，可能我們會督導中央研究院把這事情做好，希望內部開始做一些相關檢討。」
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