本土疫情自5月中爆發，時間點離放寬機組員檢疫規定，3+11非常近，後續又發生華航機師和諾富特飯店群聚感染，外界把矛頭指向此是，昨（12）日中央流行疫情指揮中心指揮官在回答提問時，自己提起「3+11」不是破口，今（14）日又花了許多時間主動說明，他強調群聚事件已經過了3個月，經過疫調和採檢找不到和社區感染的關聯性。
至於華航諾富特飯店總共7位工作人員確診，同住家屬則是3人，機師加上旅館的事件，包含後來在4月底飯店清空，機師和旅館員工全都送去集中檢疫的412人，總共檢驗1790人，都沒有職場或家庭以外的社區接觸者確診。
陳時中否認是3+11造成諾富特員工染疫，因為機組員住的時間越短，感染的機會就少，反過來說3+11，諾富特員工和機組員可能接觸的時間也更短。
陳時中強調，染疫的源頭應該是從國外來的，造成裡面傳染，但是在這裡面，旅館房務部員工1120和機師之間確切的關係，很難去真正釐清，只是在這裡，員工和住在裡面的人有染疫，也傳染給同住的家人，此案就是這樣而已。
他表示，確實是個群聚事件，已經經過3個半個月以後，對於社區的影響，在經過廣泛的疫調，並沒有找到感染可以連結的事證。尤其旅館員工是5月10日確診，家屬則是5月12日為最後一個案例，和現在沒有連結。
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