食藥署首波公費疫苗造冊人數，超過署內人數2倍，對此追查名單後續發現，其中由食藥署署長吳秀梅，擔任董事長的財團法人藥品查驗中心，也造冊175名員工施打，這也讓藍營立委質疑，檢驗等等多都是內勤做業，為何可以優先打疫苗。
簡稱CDE的醫藥品查驗中心，負責檢驗評估即將上市的新藥品，但現在因為打了疫苗惹出爭議。
記者莊鎧毓：「由食藥署署長吳秀梅，擔任董事長的，財團法人醫藥品查驗中心，當中175名人員，被列入首波施打疫苗名單，就有立委質疑當中的公平性。」
先前國民黨團就開過記者會爆料，食藥署施打名單超打169%，當時要追誰有打，食藥署僅說是外包人員，始終不肯給名單，沒想到追了一個月，查出醫藥品查驗中心也有得打，讓立委覺得事情不單純。
立委(民)李德維：「假如只是因為這個單位，是在衛福部底下，而他的董事長是吳秀梅署長，他就可以全員都打疫苗的話，我們覺得在社會觀感上是非常的差。」
而這財團法人醫藥品查驗中心，任務又是什麼？攤開公開資料來看，這查驗中心，其中董事長正是吳秀梅，董事則有衛福部常務次長石崇良，等九人擔任。
中心由衛福部出資捐贈成立，按照體制不部屬於公家機關，受聘員工也不是公務員，簡單來說就是資金全靠政府給，主要負責疫苗封緘，藥品技術資料評估，醫材資料評估等等，這看起來似乎都是以書面審查居多。
疫情中心指揮官陳時中：「有不符合資格的當然是不行，不過基本上在造冊裡面，都是符合就是一般會接觸到，藥品的檢驗封緘等等相關人員。」
指揮官幫忙背書，但還是讓藍營立委質疑，施打標準到底在哪裡。
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