國內疫苗存貨吃緊，待第四、五輪接種完畢AZ與莫德納恐僅剩不到50萬劑，指揮中心指揮官陳時中昨（6）日直呼，他也很傷腦筋，全台比他急的應該不超過10人，「3天會夢到一次」。指揮中心同時宣布開放疫苗混打，第1劑打AZ者，第2劑可混打mRNA疫苗（莫德納或BNT）。預估第1至3類完成第1劑AZ接種的70萬人可優先混打。
衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組（ACIP）日前開會，同意第1劑施打AZ疫苗者，第2劑可混打mRNA疫苗，可能優先開放第1到3類對象。陳時中昨日在記者會上表示，第1劑打AZ者第2劑可混打mRNA疫苗，目前先針對第1至3類對象做第2劑疫苗規劃，會針對第一線的醫護及專責病院服務者優先開放混打，以提升防護力，並陸續進行人數盤點。至於其餘的則視疫苗供應情況，中央再做決定。
據指揮中心數據顯示，截至5日止已有約551萬人完成第1劑AZ接種，但其中僅30.7萬人接種過第2劑，代表仍有520萬人未來有機會混打，但須等待疫苗到貨。由於目前優先開放第1劑接種AZ的第1類至第3類者混打，預估這當中有70萬人尚未接種第2劑，成為混打的優先人選。
對於疫苗混打，萬芳醫院精神科醫師潘建志日前在臉書指出，最有效的組合是先打腺病毒載體（如AZ或嬌生）疫苗，再打mRNA疫苗（輝瑞／BNT或莫德納）。他透露，過去大規模的疫苗混打不常見。
為何新冠疫情出現這種特別的策略，潘建志分析主因是AZ疫苗本來是全世界接種最多的疫苗，超過1億劑。但因血栓問題，不少國家停止使用AZ。加上AZ最大的生產基地印度血清研究所發生火災，還有印度因疫情嚴重而中止疫苗出口，造成AZ供應上一度中斷。「許多打完第1劑的人沒有第2劑可打，因此發展出混打策略。」
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