康軒文教董事長李萬吉日前違反居家檢疫規定被開罰，爆料員工傳出遭秋後算帳，被迫離職，指揮中心表示，當事人向媒體爆料，所以不符吹哨者保護相關法令，而康軒集團發聲明表示，該員工在9月26日主動交還識別證，並表示不再進公司，是自請離職。
指揮中心發言人 莊人祥：「這個部分好像不是他跟我們舉報的，這個部分好像是員工去跟媒體爆料的，有關這吹哨者保護的部分，是不是衛福部的議題啦，不是我們去爆料出來的啦。」
爆料老闆疫情「趴趴走」是不是有受吹哨者保護，指揮中心莊人祥表示，員工是對媒體爆料不是官員，得先釐清「吹哨者保護相關法令」的適用性。
當時李萬吉在中國大陸出差2個月，9/5返台偷跑去公司開會，還把手機放在家中甚至出門沒戴口罩，一開始李萬吉隱瞞違規，向新北市衛生局說外出2次在員工透露消息後，警局調監視器才發現是6次，如今員工卻在事發不到1個月就自請離職。康軒聲明稿澄清，員工是在9/26主動提離職，沒對員工有任何不利處分，更沒有逼迫離職，雙方將於10/12於新北勞工局調解，吹哨者離職時間敏感，雇傭關係又還有待調解，難免讓人有所遐想。
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