民進黨選對會已確定王美惠和陳瑩將分別出戰2026年嘉義市長和台東縣長選舉，但嘉義縣、台南及高雄市長人選的初選時程仍未定案。台南市長初選引發黨內爭議，立委陳亭妃與林俊憲陣營針鋒相對，雙方圍繞初選時程和民調結果展開交鋒。傳聞林俊憲陣營建議延後原定年底前完成的初選，引起陳亭妃質疑，但林俊憲辦公室已否認提出相關看法。
在接受TVBS專訪時，陳亭妃重申即使市長初選失利也不會離開民進黨，但她表示如果民調差距達17%還出現變數，民進黨就必須處理這個問題。她強調：「你相信台南人民會怎麼看這一局，那就是你民進黨自己要來處理這一局了。但是千萬不要因為陳亭妃講這樣，你就要亂搞。」
對此，林俊憲反駁表示：「你不能去抹黑黨，你不能給黨潑髒水，我們既然參與黨內初選，就遵守遊戲規則，像我既然參與了，我就是會接受結果。」黨內同志為了即將開打的台南市長初選相互攻擊，情況相當激烈。
林俊憲還獲得盟友支持，民進黨台南市黨部主委郭國文發表聲明，反嗆陳亭妃，黨格安在，他表示：「外界的一些質疑或者一些陰謀論，其實本黨從政同志其實不應該也不需要去附和。」
然而，陳亭妃的擔憂可能並非沒有根據。包括TVBS所做的多份民調顯示，陳亭妃在支持度上幾乎都領先。目前傳出林俊憲陣營向選對會建議延後原本預計年底前要完成的初選，但林俊憲辦公室已針對初選日期否認提出任何看法。
原本預計在7日會議中決定的初選時程，最終因意見分歧而未能定案。不過，選對會已確定2026年選戰中，王美惠將出戰嘉義市長，陳瑩則將上陣台東縣長選舉。
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