柯文哲的太太陳佩琪，近期5度砲打疫情指揮中心，26日傍晚在臉書上說以公衛角度看應該要普篩，指揮官還帶隊去旅遊，讓人民的戒心都降低，但此話一出，被網友罵翻，陳佩琪刪除部份貼文，還首度表示，不會再對防疫做評論，而對此，柯文哲和陳佩琪的看法，倒是相反。
穿著花襯衫的疫情中心指揮官陳時中，走在墾丁大街上，示範防疫旅遊，但這些畫面，柯太太，陳佩琪有些意見。
26日在臉書上寫，不普篩社區確診率低，後來指揮中心就一直強調社區很安全，於是指揮官穿著花襯衫，夾腳拖去宣導觀光，久而久之民眾戒心自然下降，陳佩琪支持普篩，也說不普篩讓她憋了很久，現在趁先生不在，把它寫出來，印象中指揮中心並未說出普篩的好處，只說普篩的壞處，所以回過頭來，不普篩是為了因為會有偽陽性和偽陰性的問題，難道醫生們不會覺得奇怪嗎，貼文一出立刻被網友罵翻，批評她又再逆時中，也和柯文哲的意見不同。
台北市長柯文哲：「在這種很低狀態下做大量的篩檢，在科學上是不合理的，所以這沒甚麼好批評的。」
網友對陳佩琪言論表達不滿，要她尊重指揮中心和公衛專家，她也罕見8度修改貼文，最後把整段講普篩的內容全部刪掉，還寫下，「小兒科醫生懂照顧病人，但的確沒公衛專業知識，謝謝大家指正，往後不會再對醫療或疫情做任何發言」，感覺心情受到影響，而事隔一天，柯文哲被問到陳佩琪的看法，還是堅持自己的立場。
台北市長柯文哲：「因為普篩做得少，那個確診案例有低估一點，但是也不會差很多，全世界還在燒所以保持警戒，有風吹草動該怎麼做就怎麼做，但是也不用在平常就搞到大家精神太緊張。」
雖然刪除部分貼文，但陳佩琪再度留言反擊，刪那段沒心虛啊，只是不想挨罵而已，畢竟回顧陳佩琪，從5/15起的貼文，從談到不該強迫大家使用「武漢肺炎」這名稱，到後來小明回家還有台灣未示警WHO等等，一個月內5度逆時中，這也五度引來順時中的網友砲轟，如今陳佩琪說不寫了，不知下次貼文，是否又將是好久以後？
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