教育部長吳茂昆一進立法院就遭國民黨立委砲轟，教育部給台大的公文未提「准」或「駁」管中閔等字眼，被外界質疑教育部在玩文字遊戲；對此吳茂昆強調公文寫得很清楚，請大家回去多看公文，只是他也被問萬一台大1、2年內沒有校長怎麼辦？吳茂昆態度強硬，直接回答「這不是教育部問題」。
國民黨立委陳學聖：「我質詢時間不想看到部長，我可以把部長請出去？」
民進黨立委莊瑞雄：「部長那麼帥，你看他一下會怎樣？」
陳學聖受不了，叫召委吳思瑤趕快休息5分鐘，好讓他能跟吳茂昆「私下聊」！私下聊的意思就是吳茂昆被藍委包夾，雙方喬好角度後上演唇槍舌戰。
國民黨立委柯志恩：「管中閔到底有沒有資格再去選校長？」
教育部長吳茂昆：「當然有資格啊，但資格的認定是遴選委員會。」
根據教育部5月4日給台大的公文，國立大學校長遴選應遵守行政程序法，但教育部5月3日才剛說管中閔案不是行政程序，不適用行政訴訟；再來，管中閔被教育部認定身兼台灣大哥大董事，卻沒有跟遴選委員蔡明興做利益迴避，只是根據100年法務部函釋，校長遴選案有爭議時應優先使用大學法，管中閔跟蔡明興兩人非配偶、血親、師生，且當時也沒有候選人對管爺提出具體不法事實。
教育部長吳茂昆：「(大學法並沒有違反利益迴避)請大家仔細看我的公文、教育部的公文就好，沒有迴避什麼，請看我們的公文裡面清清楚楚。(那您了解嗎？)我當然了解。」
面對這麼多問題，吳茂昆一直重複叫大家多看公文。
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