馬習會肩負推動兩岸和平的歷史意義，而民眾關心的，就是大陸能否撤掉瞄準台灣的飛彈。兩岸軍事專家指出，大陸對台攻擊的工具不只有軍事，網路入侵、經濟圍堵都是威脅，因此就算撤導彈也只有象徵意義，所以重要的是兩岸要明確宣示「解除敵對狀態」，建立領導人溝通機制，才是確保台海和平的重要關鍵。
大陸對台軍事威脅尚未解除，連國防部在今年10月發布的國防報告書也不諱言，認為對岸攻台戰力將在2020年做好準備，總統馬英九表示，兩岸軍事問題將是馬習會一大重點。
總統馬英九：「降低敵意才能夠促進和平，而且要以和平方式解決爭端，這一點我們在跟對方碰面的時候，我們都會進行相關的討論。」
今年7月對岸進行軍事演習，央視播出的畫面竟赫然出現類似總統府的建築物，被外界解讀就是模擬攻打台灣，同樣在7月大陸通過的《國家安全法》，內容提及維護統一和領土完整，屬於港澳和台灣人民義務引發我方強烈不滿，一直到今年9月台灣剛結束漢光演習，解放軍就緊接著在台灣海峽進行實彈演練，顯示兩岸軍事敵對狀態從未解除，而這也是馬習會重要任務。
淡大戰略研究所教授翁明賢：「敵對狀態如果不從一個法律層次把它拿掉的話，那後續你做什麼都會有很多的問題，因為你不終止敵對狀態的話，那你就沒辦法進行所謂的和平協議簽訂，那也沒辦法進行所謂的軍事互信機制的一個建構，所以這是有連帶性的。」
政大安全研究中心副執行長閻鐵麟：「大陸可以先從政策上的宣示開始，就是說兩岸的敵對已經結束了，內戰已經結束了現在正是這個兩岸關係是走和平發展，是進入一個和平發展時期，然後要把這句話列在中共法律層面的相關文件上。」
和平共處不能口惠而實不至，專家認為兩岸若要做到互信，最好是透過馬習會先談攏，讓大陸願意把解除敵對狀態白紙黑字、列入法律層級，再一步步減少對台軍事佈署或對台軍事演習，前國防部副部長林中斌呼籲北京當局，不妨藉此機會釋出善意。
前國防部副部長林中斌：「北京應該把飛彈後撤，因為他們現在放在鐵軌上面，後撤以後隨時可以運到前面，習近平內部的權威上升了，對他來說要做後撤導彈應該很有可能，那如果馬總統提，我相信有可能他會做。」
政大安全研究中心副執行長閻鐵麟：「從2006年開始，美國智庫他的一個評估報告，兩岸的這個軍力平衡已經大幅向中共傾斜，而且很難去解決這樣的一個問題，就是恢復到過去中台軍力在質量上的平衡，所以解除敵對是解決兩岸軍事問題失衡，我覺得最主要的一個關鍵。」
大陸不只是全球第二大經濟體從導航衛星、隱形戰機到航空母艦以及新型核子潛艦，都在在突顯了兩岸軍事實力差距懸殊，連美國著名智庫蘭德公司也在最新報告指出，大陸短程飛彈的數量已從1996年的10幾枚增加到1400枚，精準度甚至從數百公尺降到低於5公尺，恐怕連美國都不能等閒視之，因此專家認為透過馬習會要求對岸撤導彈，只有象徵意義大於實質意義，若能建立溝通機制，打好和平發展基礎才是關鍵。
前國防部副部長林中斌：「2004年以後，他們(大陸)國防白皮書已經明顯地透露，他們的軍事佈署是在台灣的東面，目標已經看到台灣的東面了，那麼甚至他的軍事還有其他『超軍事』的意義，經濟的、外交的等等，那是10年以前，所以這事情是很可能的。」
淡大戰略研究所教授翁明賢：「當然也有人講說，大陸他撤彈表示他的這種決心，應該跟台灣保持和平關係，但是他除了撤彈之外，他用資訊、他用網路、他用第五縱隊、他用經濟戰略，還是一樣可以威脅台灣，所以軍事威脅只是一個表象，還有很多其他的威脅，事實上台灣更應該注意。」
軍事威脅成了兩岸互信發展最大絆腳石，馬習會能談出什麼結果，外界拭目以待。
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