接連發生食安問題，讓GMP認證制度又被罵翻天。這次經濟部工業局決定訴諸民意，將在10月用民調決定GMP存廢問題。有專家認為，如果GMP要進行改革，一定要改變稽核方式、檢驗標準，並納入更多監督成員，甚至連微笑標章都得換掉，才能重建社會信心。不過值得借鏡的是，在GMP爭議這麼大的時刻，還是有沒加入GMP的業者，只靠自己就能做好源頭管理，根本不擔心原料有疑慮。
把白色的豬油塊放上平底鍋、小火拌炒，幾分鐘過後，就能炒出金黃透明的純正豬油，確認豬隻來源，就不擔心安全出問題。廚師：「豬是自己養的。」
連有認證的豬油都可能出包，生鮮通路業者做便當，乾脆產線一條龍，用自家養的海藻豬做豬油，不假他人之手，其他包括麵包的配料，加工食品的原料，多半都靠自己種、自己養，連代理進口的，還得飛到國外看產地，不然就算有好幾張認證，恐怕還是不安全。
生鮮通路業者劉天和：「像飼料這一方面的話，當然我們都有派人駐廠，所有每次飼料要製作的時候，我們都會監督我們的配方，我們的比例是不是正確，像我們在代理國外的東西，絕對我本人我都會去了解。」
黑心油風暴，越演越烈，外界歸咎於廠商沒做好源頭管理，但交通部長葉匡時認為，民眾什麼都要便宜，壓縮廠商利潤，也是食品風險的源頭之一，不過知名作家劉克襄相當不以為然。
散文作家劉克襄：「便宜又大碗，並不是造成這個(食安風暴)的最重要原因，今天餿水油問題，應該有兩個急著要解決的問題，第一個就是我們政府的把關夠不夠，第二個是業者的良心。」
近幾年食安風暴一波波，政府把關失能，責無旁貸，特別是頗具爭議的GMP制度，到底該不該留，已是接下來必須正視的課題。經濟部工業局長吳明機：「過去25年的過程中，事實上(GMP)也扮演一定的貢獻，所以我們將來這個如果GMP制度如果民調的結果，是希望退場，那可能後續的相關的配套措施，可能也要一併去思考。」
這次GMP認證再度成了眾矢之的，因此經濟部工業局宣布，10月將進行民調，決定GMP存廢，目前根據旺旺中時的民調來看，在爆發黑心油事件後，有24%的民眾贊成廢除GMP，但有將近5成的人，認為應該修正、並且保留，對照去年爆發大統油事件時，經濟部調查，有17%的民眾贊成廢除，顯然歷經這次風暴後，贊成廢除的人，又增加許多。
政大法律系副教授劉宏恩：「那砍掉重練就是指包括它，未來它GMP認證的內容，項目、標準還有組織、流程，都要做大幅度的改善，甚至你這個識別標誌，微笑標章，都要重新改成一個新的標章，不能再沿用舊的標章，否則民眾就分不清楚，究竟是舊制之下取得的，還是新制之下取得的。」
台大園藝系教授許輔：「因為在國外的時候，類似這一類制度都是由民間的公正第三方的業者，由民間來做稽核，然後由業者來自己來負責，但是在台灣變成說，由政府去主導。」
有專家認為，GMP制度歷經20幾年，球員兼裁判的弊病，必須在成員組織、監督機制上，大幅改革，才能以昭公信，因此現在經濟部工業局計畫，原本GMP只針對單一產品認證，容易誤導消費者和下游廠商，未來將改採品牌認證，也就是對生產同一類產品的產線，明年1月前，由政府查核是否符合標準，但專家認為必須全廠認證，才能發揮監督功效。
政大法律系副教授劉宏恩：「其實(產線認證)這還是不夠的，應該是針對整個工廠，不管是哪一種類別的食物，哪一個生產線，整廠認證才是正確的方向，安全衛生的問題，沒有辦法做切割處理，所以未來應該要做整廠認證，才是正確的方向。」
台大園藝系教授許輔：「小型或者是中型的食品業者，本來它的水平、水準不夠好的設備，或者是這個環境也不夠好的，經過GMP的輔導之後，它就符合了GMP的水準，讓全社會都知道說，GMP其實是一個輔導制度，那這個制度不一定可以對產品的品質跟安全去保證。」
專家認為，GMP應朝向中小企業輔導，而非保證食品安全，經濟部工業局也預告，未來一旦GMP退場，可能就得另推食安標章，或由民間自己認證，而非由官方背書，希望解決球員兼裁判，終結出了事卻找不到人負責的種種亂象。
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