當選無效之訴宣判，連宋敗訴，最主要理由是驗票沒有翻盤，對於連宋陣營主張，319槍擊案造假、啟動國安機制、剝奪軍警投票權，及公投綁大選，法官同意，這有可能違反公投法，但不至於影響民眾投票意願，加上原告無法證明，對手以暴力手段，影響選舉結果，因此判決，扁呂當選有效。
審理半年，最後判決連宋敗訴，法官費盡苦心，光判決書整本就有厚厚的接近4千頁，估計要花一個禮拜，才能影印裝訂完成，寄給陳呂連宋四位當事人，其中，最重要的理由還是驗票，沒有翻盤。
高等法院發言人溫耀源：「李昌鈺的鑑識團隊，對319槍擊事件發生的現場實際勘驗，並進行雷射彈道實驗，還比原告提出來的終端彈道重建實驗，較為接近實際發生狀況。」
4萬多張爭議票，法官一一勘驗後，有1萬8千多張是無效票，陳呂有效票11875張，還比連宋的9949張多 對於連宋質疑，假槍擊影響選舉，法官，不予採信。
溫耀源：「國防部警政署海巡署，並沒有因行政院長所宣示的，啟動國安機制，而增加留守或輪值待命人數。」
連宋說，非法啟動國安機制，剝奪軍警投票權，也被證人的證詞打敗。
至於公投綁大選，法官同意，這的確有可能違背公投法的規定，但是也不影響民眾投票的權力。
溫耀源：「也沒有去因此讓選舉產生不正確的結果，那麼這些都是我們判決理由的一些大要。」
總歸來說，法官認定，連宋提出的各項質疑，都沒有足夠的證據，證明陳總統是用暴力脅迫等手段，影響選舉結果，所以判他們敗訴。
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