國衛院最新研究發現，因為國內住院用的抗生素已經濫用到第二線第三線，也就是藥越下越重，因此台灣過半數的住院病人，身上都有抗藥菌株，有些醫院甚至高達85%；也就是說，如果病人只是盲腸炎開刀住院，卻因為隔壁床感染抗藥菌株，不慎感染，造成後發性感染，甚至沒藥醫，就會致死。
只是開個盲腸炎小手術，卻因為同病房的另一位結核病患有多重抗藥性，不小心被感染，得多住院好幾天，甚至因此感染敗血症一命嗚呼，國衛院發現，這樣的比例，在某些醫院已經達到8成5！
國衛院臨床研究組主任蘇益仁：「住院以後3天以後，就發燒，就得到（感染），那就是在院內得到的感染，這個比例在台灣平均是5點多，得到膿瘍肺部的感染，或是怎樣的感染，那麼可能就要多停留在醫院，甚至是可能是會造成死亡。」
國衛院認為，主要原因就是醫院感染控制沒有做好，也可以說SARS過後，醫護人員對於感控防線越來越鬆，甚至自己本身都帶有抗藥菌株。
蘇益仁：「我們發覺到醫師護士，這些工作人員來源的機會比較大，就跟SARS一樣，就是在看完一個病人沒有洗手，就把這個細菌傳到另一個病人去，結果在加護病房，原來他只是一般的心肌梗塞，可是隔壁的細菌就感染他了，反而都出不來。」
尤其部分醫生乾脆直接開萬古黴素等後線抗生素，專家擔心，如果繼續濫用，反而會出現更多新型的抗藥細菌株，到時候就會面臨無藥可用的窘境，住院治療也沒用！
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