兩岸直接通航，根據兩岸海運業者的估算，運輸成本最多可降低30%，航程縮短一半，而兩岸港口也都在打算盤，希望搶下直航商機，大陸多達63個對接港口，距離最近的福建，因為台商聚集，也有不少優勢，還有台商準備購船，跟兩岸航空客運業者搶客源。
擁有10萬噸級航道的福州新港，為不凍港，可全年全天候靠泊，目標在2010年，晉升為大陸沿海十大港口。
11月4日，海基、海協兩會簽署四項協議後，兩岸航運直航，讓福州港嗅到新商機。福州新港貨櫃碼頭經理葉關勇：「兩岸貨運方面，我們也派出了很多業務代表，進行市場調查，同時也進行廣泛的宣傳，就是對台（航運）我們的優勢，我們的實力在哪裡。」
位於海峽西岸的福州新港，距離基隆港150海浬、台中100海浬、高雄170海浬，可承接大陸長三角以及珠三角兩大經濟圈。兩岸海運直航，貨船航程從20多個小時，縮短為8到10小時，運輸成本降低了15%到30%。
而建設中的江陰疏港鐵路一旦完工，接連大陸東南鐵路網，經濟輻射效應即可顯現，港口內的保稅物流園區，也早在今年6月，就與基隆港區代表開會，提出合作建議。福州保稅區管委會副主任李平：「監管的對接、貨物直通的對接、文件文本的對接、軟體系統的對接、企業落地的對接。」
福州馬尾港與馬祖的兩馬航線，行之多年，現在海運可直航，台灣船東也嗅到商機，以低票價來跟航運業者搶客源。
福州台商陳奕秋：「馬尾到基隆是8小時50分左右的時間，如果跟飛機對比的話，我們只有1/3的運費，在時間上可能比他們（空運）長，但是在效益上，有更多人也會坐我們的船。」
台商陳先生說，將投入上億元台幣，購買兩艘新客輪，一艘走原本的兩馬航線，另一艘走福州基隆兩點直航；而為了迎接台灣客人，福州港馬上也將動工，改造擴建客運站，預計在明年6月完工。
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